从经济运行机制上讲的深港合作就是在“九七”香港回归后，两地的劳动力、商品和资本自由流动，实现经济的一体化。 1、如果说15年来深圳的改革开放取得了举世瞩目的成就，那么，面临中国全方位改革开放格局的形成以及世界经济发展的挑战，提出并实施深港经济一体化战略，无疑是将深圳的经济体制、经济运行机制和经济活动完全纳入到市场经济和国际经济的轨道上。 站在21世纪的高度，综合考虑中国“复关”和“九七”香港回归等因素，深港合作就是将把深圳造就成中国内地的“第一个香港”。这将为中国的进一步改革开放树立新的里程碑，其深远意义和影响远远超过了深港经济合作本身。 2、15年来，香港借助于深圳的开放发展，顺利地将劳动密集型产业向北转移，完成了产业结构的调整，社会经济进入了后工业化发展时期；在此之间，深圳依靠中央的政策和自身的努力，借助于香港的资本技术和信息，一跃而进入了社会经济发展的工业化时期，城市综合实力名列全国前茅。鉴于香港地域狭小，高新技术产业薄弱，港口吞吐量趋于饱和等“瓶颈”因素的制约；鉴于深圳的现状和未来经济发展的产业结构、市场取向、基础设施建设、资本需求状况，以及经济体制改革的目标模式选择等等状况，深港两地必须加强合作。深港合作是深港两地经济发展的内在要求和必然选择。但这种选择不是以往的简单互补合作，而是经济上最高层次的一体化合作。 3、深港合作的过程就是深圳经济体制改革和经济增长方式转变的过程。深港合作促进深圳的“两个转变”，深圳实现“两个转变”会使深港合作得更快更好。第二次创业目标的实现取决于深港合作和“两个转变”的实现程度，第二次创业的目标结果就是实现深港合作和“两个转变”，而深港合作和“两个转变”又是第二次创业的条件和手段。 深港合作是一项复杂庞大的系统工程。它不仅涉及到法律、政策、体制和行政效率等软件机制条件，还涉及到基础设施等硬件基础条件。实现深港合作，必须采取多项措施对策，其中最主要的是以下三个方面： 一是建立符合国际惯例的市场制度和行政效率机等软件体系，这是深港合作的前提和必要条件。其中包括：中央政府赋予深圳特区某些自由港的特殊政策，建立健全与香港经济运行机制和法制相适应的法规体系。目前，首要的是对外商、外国公民和港商、港人实行国民待遇，取消对某些产业行业的投资经营限制，允许外商投资经营各类产业并开放所有市场；切实转变政府职能，提高行政效率。按照经济水平、体改进程、人口比例并借鉴国际经验确定公务员数量，设置行政机构，提高行政效率。加强反腐败立法，加大执法力度，确保政府机构的公正廉洁。 二是重点研究规划深港金融合作，这是整个经济合作的关键。一方面，国际区域间的经济一体化，是以金融一体化作为条件手段。另一方面，深圳未来的发展，需要巨额资金，必须依靠国际金融市场筹措。虽然深港金融合作比其它产业合作困难更多，但深圳金融业比较发达，市场化程度较高；同时，香港的国际金融中心地位一直面临着新加坡、台湾的竞争和挑战。深港两地金融业只有加强合作，才能确保香港的国际金融中心地位立于不败之地。 深港金融合作包括金融方式、货币流通和金融市场三方面的合作。在货币流通合作方面，人民币可先在特区自由兑换，按先居民、再企业、后机构的顺序过渡，最终实现双币双向自由流通。 三是率先进行深港产业合作，这是整个经济合作的主要内容。深港产业合作总的思路应该是：首先实现基础产业的合作，香港港口的吞吐量已趋于饱和，而深圳某些港口只达到设计能力的四分之一，口岸交通堵塞已成深港两地的一大难题。因此，合作的当务之急是实现港口、交通运输等基础产业的一体化；其次是深港两地应该协调制定高科技产业发展战略，加深科技产品开发应用推广的合作，参与国际市场竞争；第三是加强两地贸易、信息和旅游业的合作，促使深圳成为香港第三产业北移的第一阶梯，最终将深港经济关系由现在的“前店后厂”互补型转变成互补——竞争——体型。
