祖国大陆与台湾的经贸关系虽然一直处于非直接双向的不正常状态，但由于存在巨大的资源互补和血缘地缘优势，在经济利益驱动和市场原则导向下，两岸经贸交流发展迅速，20多年来，已形成互利互补，相互依存的局面。 2000年台湾当局权力更替，代表台独势力的民进党上台，使两岸经贸交流中的不定因素增加，风险上升，但当年两岸经贸往来并未因此受阻，反而创造历史最高纪录。2000年，两岸贸易首次突破300亿美元大关，达305.33亿美元，比上年同期增长30.1%，是1979年两岸贸易额的396.5倍。截至2000年底，两岸贸易总额累计1909.33亿美元，其中大陆对台出口310.4亿美元，自台进口1598.94亿美元。台湾已成为大陆第五大贸易伙伴，第二大进口市场；大陆是台湾第二大出口市场和最大贸易顺差来源地（见表1）。 表1 1991年—2000年两岸进出口贸易统计表 单位：亿美元 年份 进出口总额大陆出口 大陆进口 贸易差额 金额 年增长% 金额 年增长% 金额 年增长% 1991 43.34 68.3 5.95 49.9 36.39 61.37 -30.44 1992 65.59 51.3 6.94 16.94 58.66 61.20 -51.72 1993 143.94 119.5 14.62 110.70 129.31 120.44 -114.69 1994 163.28 13.4 22.42 53.35 140.86 8.93 -118.44 1995 178.829.5 30.98 38.18 147.84 4.96 -116.86 1996 189.856.1 28.03 -9.5 161.82 9.96 -113.79 1997 198.384.5 33.96 21.20 164.71 1.60 -130.45 1998 204.993.3 38.70 13.90 166.30 1.10 -127.60 1999 234.814.5 39.5 2.1 195.3 17.4 -155.8 2000 305.33 30.1 50.427.6 254.94 30.6 -204.54 资料来源：中国海关统计。 1999年底，国务院颁布《中华人民共和国台湾同胞投资保护法实施细则》，与1994年《台湾同胞保护法》共同构建了保护台商投资大陆的法律保障体系，对促进台商投资大陆起到重要作用。2000年台商投资大陆再现高潮，新批项目3082家，同比增长22.2%。据台湾经济部统计，2000年1月－11月台商对大陆投资占台湾岛外投资的近38%，创历史新高，大陆已成为台商海外投资的首选地区。台商对大陆投资形态也发生重大改变，已从最初的中小企业以降低成本为目的的外延式投资转变为大企业、上市公司和高新技术企业的扩张式投资。截至2000年底，大陆累计批准台资企业4.7万家，合同金额486.6亿美元，实际利用台资金额263.8亿美元（见表2）。 表2 1991年—2000年台湾对大陆投资统计表 单位：亿美元 年份 企业数 协议金额 年增长% 实际金额 年增长% 1991 1735 13.90 54.64.66 109.9 1992 6430 55.43 298.7 10.50 125.3 199310945 99.63 79.9 33.55 219.5 1994 6247 53.95 -45.9 33.910.1 1995 4778 57.77 7.0 31.62 -6.7 1996 3184 41.40 -28.4 34.80 10.1 1997 3014 28.14 -32.0 32.89 -5.5 1998 293731.1 10.4 30.5-7.4 1999 252334.2 10.2 26.2-13.8 2000 3082 39.88 16.5 23.78-9.4 资料来源：外经贸部统计。 两岸经贸交流对两岸经济发展起着重要作用，尤其在台湾经济中的地位举足轻重。随着两岸经贸往来的深入，一个次区域分工体系正在形成。但可惜的是，由于两岸间的政治分歧，特别是台湾当局对大陆的不信任和疑惧心理，并由此制定的限制两岸经贸发展的政策，阻碍了两岸经贸的正常往来，人为扭曲了市场形态，给两岸经贸前景带来不确定因素，使得两岸经贸合作不能完全依据市场需求合理发展，影响效益最大化和国际竞争力的提升。 同在WTO框架下 由于历史形成的特殊原因，虽然同属一国，祖国大陆一直把对港澳台的经贸关系视同国际经贸关系，遵循一般国际经贸规则。这种做法已得到国际社会的普遍承认，也保证了四地的国际经济地位和经济利益。依据“中先台后”的原则，中国一旦入世，台湾也将以“台湾、澎湖、金门、马祖单独关税区”名义加入WTO。GATT和WTO把主权国家内存在的单独关税区定义为“一个与其他领土之间大部分贸易保持着单独税率或其他单独贸易规章的地区”，其核心宗旨为“区域经贸政策的独立性”，并不涉及国家主权其他方面，因而并没有，也不可能根本改变两岸经贸关系性质。但是，入世表明两岸将以独立成员的身份共处于一个国际经济组织之内，承诺遵守共同的国际规则，因而使两岸经贸往来的条件发生很大变化：
