（一） 作为改革的产物，乡镇企业在即将跨入新世纪的前夕，遇到了一些新的问题，从深层原因来说，主要是有些企业产权不清、体制不顺、机制不活。解决好这些问题，必须依靠深化改革，这是保持乡镇企业健康稳定发展的关键。 改革首先要从所有制问题入手。乡镇企业现有的所有制格局，也是在改革中逐步形成的。 1978 年以前，乡镇企业只有单一的社办企业。1978—1984年，增加了农、商、建、运、服各业，增加了队办层次，统称社队企业。1992年以后，形成了以集体经济为主导，“多轮驱动，多轨运行”的格局。 改革的重点是乡村集体企业。乡村集体企业在农村经济中起着主导作用，作出了历史性的巨大贡献。但原有的乡村集体企业的组织形式和实现形式比较单一，随着社会主义市场经济的发展，产权不清、政企不分、体制不顺、机制不活、管理不善等问题逐步暴露出来，迫切需要通过深化改革，为焕发企业新的生机和活力提供制度、组织和动力保证。 改革的形式应多种多样。在改革中，要以“三个有利于”为标准，尊重农民的实践和创造，因企制宜，不搞行政命令，不搞一个模式，不搞一哄而起。股份制、股份合作制、组建企业集团、租赁、兼并、出售等形式都可以试。股份有限公司和有限责任公司比较适合于大中型企业和企业集团。股份合作制是新型的劳动群众集体企业，适合中小企业。 发展混合型经济是一个方向。混合型经济是聚集各种社会资本的有效形式，适应性强，兼容性大，可以突破原有企业封闭的社区范围，使乡镇企业可以在新的更大的范围内配置各种资源，优化生产要素。通过发展混合经济，集体资产可以通过参股、控股的方式实现，实现产权和投资主体的多元化，真正搞活集体企业。 改革要注意三个问题：一是严格资产评估和存量量化，二是要把改革改制和加强管理结合起来，三是要搞好资产管理，确保集体资产的保值增值。 （二） 乡镇企业的结构问题，既有所有制结构和布局结构的问题，也有产业和产品结构的问题。调整结构是今后乡镇企业发展中面临的一个重大任务。 调整结构的目的在于优化结构和结构升级。乡镇企业外延扩张和速度增长的时代已成过去，如果不培植新的增长点，不实现主导产业的更新和经济结构的优化升级，就难以适应市场经济的新要求。现在一些效益不好，亏损严重，甚至破产的企业，几乎都和产业、产品结构不合理有关。 调整结构要实行市场、资源、产业政策“三导向”。最关键的是市场导向。我国经济已全面进入买方市场新阶段，95%的产品供求平衡或供过于求。然而，一方面大量产品积压，另一方面大量潜在的需求尚没有满足，这就逼迫乡镇企业着眼市场需求，抓住现实需求，研究诱导需求，看到潜在需求，使产品生产与市场需求达到高度一致。 调整结构要顺应农业产业化方向。乡镇企业不占优势的产业要尽早转向，避免与城市的企业同构。农业产业化的发展要靠“龙头”企业的带动，与农业有着血缘关系的乡镇企业应理所当然地承担起“龙头”的责任，大搞农副产品加工和流通这一魅力无穷、潜力巨大的产业。 调整结构还要把发展第三产业作为重点。发达国家第三产业都在60%左右，我国不到30%，而乡镇企业只有15%，因此，发展的潜力很大。要把发展乡镇企业的布局调整——建设工业小区和产业调整——发展第三产业结合起来。城镇化进程加快了，就会带动第三产业发展，才能更多地吸纳农村剩余劳动力。 （三） 虽然经过十几年的发展，乡镇企业素质有了很大程度的提高，但从总体上看，多数乡镇企业整体素质偏低，产品科技含量较低，经营管理比较粗放，技术装备水平较差，专业技术人才缺乏。 提高自身素质是乡镇企业长期的任务，当前要从三个方面着手： 在科技进步上，乡镇企业要逐步建立自主创新的技术进步机制，有条件的大中型乡镇企业都应建立科研开发机构，同时应大幅度提高技术改造投资占固定资产投资的比重，使企业真正成为技术开发和技术投入的主体，以增强自身的技术创新能力。 在人才开发上，乡镇企业要逐步建立有利于人才成长、充分发挥人才作用、保护和调动人才积极性的环境和机制。要树立“一方水土，养八方人才”的新观念，多渠道培养和引进留得住、用得好的各类人才。 在内部管理上，乡镇企业要牢固树立管理也是生产力的观念，建立健全先进、合理、科学配套的基础管理工作体系，积极运用现代化管理方法和手段，努力实现管理方式的转变。加强管理，当前应从有效解决企业面临的突出问题入手，提高产品质量，压缩“两项资金”和“三非”支出，降低企业负债率。
