一、审计制度及审计组织 台湾地区监察院设审计部，负责各级政府及其所属机关的审计业务，审计部的职权包括：①监督权：监督预算的执行；②核定权：核定收支命令和财务责任；③审核权：审核财务收支、审定决算；④稽查权：稽查财物及财政上不法或不忠的职务行为；⑤考核权：考核财务效能；⑥其他依法应办审计事项等职权，此外还兼容合规性及绩效性审计。审计机关整合性功能如下：①监督功能，主要是审计机关预防及侦测政府各机关可能发生的错误、舞弊及浪费等事情，具体工作包括办理合规性审计、审定决算及审编总决算审核报告等，以发挥课责机制的监督功能；②洞察功能，主要是审计机关考核政府各机关施政计划的经济性、效率性及效果性，具体工作包括办理绩效审计及提出建设性意见；③前瞻功能，主要是审计机关预测政府各机关法定职责及新挑战，并确保在未涉及行政权责的前提下，提出建议供决策参考。 台湾的审计机关设有审计部及所属第一、二、三、四、五厅、教育农林审计处和交通建设审计处以及复审室，负责办理全台湾及所属机关的审计事务；另下设直管台北市、新北市、台中市、台南市、高雄市等5个审计处；各县市及金门县，设17个县市审计室，分别掌管各地方政府和所属机关的审计事务及办理指定审计事务。 二、政府绩效审计在台湾的发展历程 政府绩效审计在台湾发展经历了三个阶段。一是早期（1911年至1971年）办理合规审计，确保财务报表的可靠性。1931年审计院改为审计部，归属监察院，其间政府财务制度实行财务联综组织，政府收支必须通过财务、公库、主计与审计四大系统，并采取审计超然、审计独立制度；预算的编制，属行政院责权；预算编制又由立法院审议决定，预算执行结果即决算审核，由监察院审计长司理，此谓三权财政，各司其责，审计工作主要以合规审计为主。 二是中期（1972至2008年）修正审计法，增列考核政府效能，逐步推动绩效审计。1972年修正了审计法，在原合规审计职权以外增加了考核财务效能的规定，审计职权扩展到兼容合规审计和绩效审计，审计方法以推行综合审计为目标。2001年起正式引入“新公共管理制度（简称NPM）”，建立施政绩效管理制度，提升行政效率及服务效能，强化政府各机关的策略规划及执行能力。配合行政部门施政管理的改革，审计机关加强推进绩效审计，负责执行独立性评估，政府审计的重心从合规性审计转变为绩效审计。 三是近期（2009年至今）积极转型为绩效评估者，发挥政府审计的前瞻与兴利功能。引入美国联邦审计署（简称GAO）2006年首倡的“审计机关成熟度模型”，认为政府审计机关的角色应从早期的监督逐步迈向洞察和前瞻，以拓展审计功能。2009年制定了《绩效审计相关作业规则》，建立了《审计机关策略管理与绩效评估机制》，督促政府各机关提升施政绩效，并协助其建立风险管理机制，以增强管理服务功能。
