进入21世纪，日本有关日中战争史的代表性研究，主要可分为三类：其一是为纪念日本战败60周年进行的综合性研究，以及日中美三方学者关于日中战争史的国际共同研究；其二为中国现代史研究会(东京)及日本上海史研究会等校际研究会所展开的共同研究；其三是学者关于日中战争史的自主研究。这一归类大致可以反映出日本史学界长期以来的学术传统。本文将分别予以介绍，以此展示近年来日本学界关于日中战争史研究的整体动向。 首先要提到的多卷本著作，是《岩波讲座亚洲·太平洋战争》(共8卷，编辑委员：仓沢爱子、杉原达、成田龙一、Tessa Morris-Suzuki、油井大三郎、吉田裕，岩波书店2005～2006年版)，这是在经历了战败后的60年，日本学界对于1945年夏天结束的太平洋战争所进行的综合性研究。 1945年的战败，将日本社会的发展阶段明确划分为战前与战后两个阶段，这一重大事件也对整个世界及社会的认识产生了决定性影响。基于此，岩波书店出版的这套系列讲座丛书，旨在借战争结束60周年之际的纪念性影响，对战争的历程以及战争行为本身做一个重新的考察。从全卷的基本框架来看，没有延续过去使用的“大东亚战争”“太平洋战争”“十五年战争”来命名1945年结束的这场战争，而是使用了“亚洲·太平洋战争”这一新概念，力求跳出战争时间与空间的限制，并着眼于殖民帝国与殖民地的关系，同时将考察时段由战时延伸到了战后，力图展示出一幅历史与现实相关联的新图景。该书提出三个值得注意的问题：1.关于“十五年战争”这一认识，具有“单一国别史”及“单线性”的侧面；2.提出了社会性别、族群、战争记忆与叙述等与战争研究有关的一些新概念、新方法；3.关注日本“帝国”的殖民地统治及去殖民地化这一课题的重要性。 这套丛书的第1卷《为什么是亚洲·太平洋战争？》中，包含了战争系谱图(成田龙一)、日本的帝国经历(杉原达)、当下的战争责任论(吉田裕)、日本近代史上的战争与殖民地(荒井章二)、20世纪亚洲的战争(仓、浞爱子)、世界战争中的亚洲·太平洋战争(油井大三郎)、讲述暴力的可能性(Tessa Morris-Suzuki)以及历史修正主义(岩崎稔、Steffi Richter)等主要内容。 第2卷《战争的政治学》汇集了东京裁判论(野上元)、祭奠与追悼(原田敬一)、帝国日本的“随军慰安制度”论(SOH，Chunghee Sarah)等内容。 第3卷《动员·抵抗·翼赞》主要从人性的视角讨论了战斗的士兵·守卫的士兵(河田明久)。 第4卷《帝国的战争经历》分别考察了殖民者视野下的台湾(近藤正己)、帝国的劳务动员(内海爱子)、从神户港看强制劳工问题(飞田雄一、安井三吉)、战后“撤离”与“扣留”(成田龙一)、台湾原住民的殖民地化与去殖民地化(傅琪贻)、刘连仁·横井昭一·“中村辉夫”眼中的战争(丸川哲史)和后殖民地式的“重逢”(高媛)等问题。 第5卷《战场面面观》集中讨论了战场上的暴力行为，如士兵们的日中战争(山田朗)、亚洲·太平洋战争中的战场与士兵(吉田裕)、中国战线的诸种非正规战(菊池一隆)、南京大屠杀事件(杨大庆)、治安战的思想与技术(笠原十九司)、日军的性暴力及其特征(山下英爱)和从战略性轰炸到原子弹投放(伊香俊哉)等。 在第6卷《日常生活中的总体战》中，主要考察了日本民众及中国沦陷区民众在战争影响下的日常生活样态。 第7卷《统治与暴力》则以中国沦陷区为叙述主体，分析了满洲国的民族与民俗学(杜赞奇)、日中全面战争结束后的在日华侨、印侨群体网(笼谷直人)、汪兆铭政权论(刘杰)和内蒙古的“蒙疆”政权论(Li Narangoa)等主题。 在第8卷《20世纪的亚洲·太平洋战争》中，较为宏观性地分析了世界大战与帝国重组关系(木畑洋一)、战争与革命(加藤哲郎)、亚洲·太平洋战争与“一般性”国际机构的形成(半泽朝彦)、战争赔偿与补偿(矢野久)及战后责任与和解探索问题(阿部浩己)。 2000年，傅高义(哈佛大学教授)发起由日中两国研究者共同研究日中战争的倡议，并提出了共同讨论的四个视角：1.日中战争中的地方政权；2.军事史；3.社会与文化；4.外交与国际关系。以此倡议为基点，日中美三方组成了共同研究团队，并依次在哈佛大学(2002年)、夏威夷(2004年)、箱根(2006年)和重庆(2009年)举办了国际学术研讨会。该团队经进一步调整后，于2013年在重庆召开了第5次会议。 会议成果已集结成日文、中文以及英文的论文集。日文版论文集《关于日中战争的国际共同研究》(庆应义塾大学出版会)系列包括：姬田光义、山田辰雄编《中国的地方政权与日本的统治》(2006年)；波多野澄雄、户部良一编《日中战争的军事部署与展开》(2006年)；傅高义、平野健一郎编《日中战争时期的中国社会与文化》(2010年)；西村成雄、石岛纪之、田嵨信雄编《国际关系中的日中战争》(2011年)；久保亨、波多野澄雄、西村成雄编《战时中国的经济发展与社会变化》(2014年)。
