银行存款是货币资金最主要的部分，在单位作为重要的支付手段，大量发生，在整个会计活动中占有相当大的比重。由于其具有流动性大、使用灵活、容易兑现的特点，极易发生贪污、挪用等违纪违法行为。有效地开展银行存款审计，是规避审计风险的一项基础性工作。 银行账户结存额的审计，是银行存款审计的一项重要内容，一般是将单位银行存款日记账月底结存额与银行对账单相核对，并通过银行存款余额调节表对差错事项和未达账项调节一致，来查证是否利用银行存款进行舞弊行为。 但目前各单位财务人员紧张，特别是乡镇财政所，很多会计兼任出纳，单位银行存款控制系统并不健全，银行存款资料不完整，单位从银行拿回的对账单一般只有月底存款余额，没有收支明细，审计中如果简单的查看单位银行存款日记账月底结存额与银行对账单余额一致就不再深究，往往会使一些贪污、挪用行为被掩盖。因为进出单位账户的资金都不入账，不影响账户余额，若出纳人员将进入单位账户的收入即时取出，进账单和支票存根都不入账，或者月初将资金从银行取出，月底再存入，支票存根和缴款单都不入账，这样单位银行存款日记账的月底余额与银行提供的对账单月底余额仍然一致。 因此，在对银行存款审计时，首先要对被审单位银行存款控制系统健全性开展调查，测试控制措施执行的有效程度，如职务分离、复核、签领、保管、银行存款余额调节表编制这些标志控制的有效性。如果控制措施执行不到位，必须要求被审单位提供银行对账单明细，进行逐笔核对，对单位编制的银行存款余额调节表中没有列出的未达账项深入核查，看有无贪污、挪用行为，而不能因为核对工作量大，就轻易放过，使审计存在风险。
