美国国防部是美国联邦行政机构中开支最大的一个部门，其年度预算占整个联邦政府财政预算的20%左右。为确保巨额经费的规范使用，美国建立了内外结合的审计监督制度。其中内部审计监督主要是美军自身建立的审计机构对军事经济活动实施的监督。美军国防部由国防部长办公厅(Office of Secretary of Defense)、参谋长联席会议(Joint Chiefs of Staff)、3个军种部(Military Departments)、 10个联合作战司令部(Unified Combatant Commands)、国防部所属16个局(Defense Agencies)和7个专业机构(DoD Field Activities)组成。这些组织基本建立起了相应的内部审计机构。 国防部长办公厅及国防部有关业务局的内部审计 美军国防部长办公厅由部长、第一副部长、5名副部长（政策副部长、审计副部长、人事与战备副部长、情报副部长、采办技术与后勤副部长）、3名助理部长（法律事务助理部长、公共事务助理部长、网络与信息一体化助理部长）、法律总顾问、作战试验与评估主任、情报监察事务部长助理、总监察长、行政与管理主任、部队转型主任、基本评估主任、项目分析与评估主任以及相关职能部门组成。 由其构成可以看出，部长之下专设一名兼任首席审计长的副国防部长，统一领导和管理全军的财务与审计工作。该副部长与其他副部长之间没有隶属关系，由部长和第一副部长的领导。 审计副国防部长还同时领导两个直属于国防部的业务局：国防财会局(Defense Finance and Accounting Service)和国防合同审计局(Defense Contract Audit Agency)。其中，国防合同审计局是美军国防合同的最高审计机构，负责国防部的全部合同审计工作，并为国防部具备采购和合同任务的部门就合同和转包合同问题提供会计和财务咨询服务。该局下设国防合同审计所和技术勤务中心两个业务单位；此外还下设若干地区分局和几百个审计办事处，约有数千名官员。国防合同审计局与国防合同管理局(Defense Contract Management Agency)之间没有隶属关系。国防合同管理局由采办技术与后勤副国防部长领导，负责为国防部、其他政府部门、外国政府、国际机构以及其他授权机构提供合同管理服务。 在国防部直属的军事经济活动比较多的另外两个业务局——国防后勤局 (Defense Logistics Agency)和国防给养局 (Defense Commissary Agency)也设置了相应的审计机构。国防后勤局在局机关配备了一名审计长专职负责该局的内部审计工作，国防给养局则设置了内部审计办公室对该局的经济活动实施监督。此外，美军国防部审计长还是国防规划与资源委员会、国防采办委员会的主要成员。国防规划与资源委员会负责就防务规划、计划和预算问题向国防部长提供决策建议；国防采办委员会负责对重要武器计划项目分阶段进行严格有效的审查，为采办过程中各个关键的决策点提供决策依据。 参谋长联席会议的内部审计 美军参谋长联席会议由参联会主席、副主席、陆军参谋长、海军作战部长、空军参谋长和陆战队司令组成。其主要职责是在平时向总统、国家安全委员会和国防部长提出关于军队建设、国防发展项目与预算、采购需求评估、联合作战条令、联合训练政策等方面的建议；在战时协助国家指挥当局对美国武装力量实施战略指挥，监督各联合司令部的军事活动。联合参谋部(Joint Staff)是参联会的常设机构，由参联会主席全权领导，设置一个管理部和八个职能部（如人力人事部、后勤部、部队结构、资源与评估部等）。在管理部下面设置审计办公室，负责联合参谋部的内部审计工作。 军种部的内部审计 美国国防部下设陆军部(Department of the Army)、海军部(Department of the Navy)和空军部(Department of the Air Force)三个军种部，直属国防部长领导。军种部没有作战指挥权，只负责各自军种的人事管理、训练教育、军事科研、武器装备和后勤保障等工作。美军在陆海空三个军种部均设有一名审计长，通常由负责财务管理的助理部长兼任，分别领导各军种审计局负责各军种的审计工作。此外，他们在各军种部下属的一级司令部也基本设置了相应的审计机构，如陆军部下属的军事交通管理司令部，在其参谋部下设了内部审查与审计办公室；海军部下属的军事海运司令部在其内部也设置了审计处；空军部下属的空军器材司令部、空中机动司令部等，则配备了专司审计的副参谋长。 联合作战司令部的内部审计 美军目前共有10大联合作战司令部，其中6个为战区司令部，包括中央司令部(CENTCOM)、欧洲司令部(EUCOM)、非洲司令部(AFRICOM)、北方司令部 (NORTHCOM)、太平洋司令部(PACOM)和南方司令部(SOUTHCOM)；4个为职能司令部，包括联合部队司令部(JFCOM)、特种作战司令部(SOCOM)、战略司令部 (STRATCOM)和运输司令部 (TRANSCOM)。这些联合司令部都设置了相应的审计机构，负责各司令部的内部审计工作，如太平洋司令部在首长办公室下面设置了审计办公室，联合部队司令部在参谋长下面设置了审计处等。而且，在美国的一些军事院校，如国防大学等，也建立了审计机构，负责本院校的内部审计工作。
