当前，对审计整改的普遍做法是，由审计组进一步督促检查审计意见的落实情况，并将整改情况写入审计报告，予以公告。简言之：谁发现问题，谁负责跟踪检查，督促整改。这一做法明显存在不足：首先，审计机关主导问题整改，并公告被审计单位整改情况，实际是由审计组几个同志在实施具体工作，其力度必然有限，容易出现审计公告与整改问题时间冲突的矛盾。由此可见，现行做法是一种权宜之计，难以改变屡查屡犯的现状。这是因为由审计机关主导督促问题的整改，并在审计公告中转述审计意见和建议的落实情况，缺乏公众参与，一方面被审计单位没有直接面对人民代表大会和公众，另一方面人民代表和公众的质询问责又没有合法的场所和手段。现行做法使审计出的一些问题未能彻底整改，尤其是一些需要建章立制的审计建议落实情况如石沉大海，不见下文。没有有效地对问题整改和问责机制，审计就无法发挥制度建设的作用。这一问题实际是现行监督制度的不完善，实质是国家“免疫系统”运行的最后环节缺失。 英国、美国、德国、印度等国家审计机关对审计出的问题，不直接要求被审计单位整改，而是在审计报告中披露问题，并提出改进建议，向社会公布审计报告，通过议会和公民对审计出的问题提出口头和书面质询，由被审计单位答复，促使被审计单位认真整改，实现对预算资金使用情况进行有效的监督。据此，笔者建议，在我国也要建立审计整改报告和质询制度。对此，笔者提出以下建议： 建立由人民代表大会主导，政府和公众参与的问题整改和质询机制。人大常委会设立专门委员会，建立例会制度（不只限于在人大会议期间，而是经常或定期的），被审计单位向人大报告对所查出审计出问题的整改情况、审计意见的落实情况，接受人大代表、专家等参会人员的质询，公民可以旁听。以调动各方的积极性，吸引公众参与，做到公开透明。审计机关应负责对被审计单位整改成效进行评估，如实反映审计意见和建议的落实情况，并公开评估报告，确保审计整改的真实、有效。可以通过媒体，公布被审计单位整改情况，回答公众的质询。
