一、注意核实企业收入、支出是否准确。收支是否按会计制度核算，有无销售收入不记收入账或直接冲减成本费用的问题，有无虚列成本费用或成本核算不实的问题。重点检查企业有无其他收入不入账或虚列成本费用转移支出而形成账外账的行为。 二、注意企业纳税申报是否及时完整，是否存在少报、漏报或偷税行为，延期缴纳税款是否按规定报批和缴纳滞纳金，对违法行为的处理处罚是否按规定履行。重点检查企业计算缴纳税金的纳税依据、使用税率是否准确，应缴纳税金与完税凭证一致。 三、注意对减免税企业检查。主要是减免税企业的性质是否符合规定减免，有无扩大减免税的范围，减免税期限的执行情况，有无利用优惠政策少缴其他税款。重点检查对减免税企业性质、条件、范围等资格审查，减免税企业的政策执行情况。 四、注意企业财务制度执行是否规范。账与凭证、账表、账实是否一致，会计资料是否完整规范。发票的取得、使用与保存是否符合发票管理的规定。重点检查企业财务各相关数据规范准确；对企业发票的领购方式、填写使用、保存形式是否符合规定，因为发票是会计核算最基本的资料，发票管理不规范直接影响企业会计核算的真实性。 五、注意检查企业执行税法管理的严密性。税收政策及税法规定的落实是否及时到位，各项费用列支有无超出法规政策限额比例，或税收政策到期而企业仍在执行的问题。征管过程中有无死角或漏洞。代扣代缴、代收代缴税款的义务人是否完整及时按规定代扣代缴税款。其他地方小税种是否及时足额上缴。重点检查企业在改制、兼并等过程中的法规政策执行情况，关联企业之间财务处理程序内容。检查企业计算应纳税所得额调整增加和调整减少的各项政策依据。审查企业扣缴义务人的资格、扣缴税款台账及申报解缴情况。另外，在近年的税收征管延伸审计中，发现随着税收征管体制改革的不断深入与完善，税务部门内部新形成的与企业约谈、纳税评估等缴纳的税款方式，如果仍立足于以税务部门的会计资料为重点进行审计，就无法客观完整地反映税收征管中存在的问题，也无法提出对症的审计建议。因此，必须改变以往的查账模式，进一步加大对纳税单位的延伸审计力度。
