在2006年三峡重庆库区移民资金审计中，重庆办紧紧围绕国家关于三峡移民“搬得出，稳得住，逐步能致富”的工作目标，积极探索专项资金效益审计思路和方法。该办围绕国家设立三峡移民资金的政策目标，将审计目标确定为检查国家有关移民政策的落实情况，调查影响移民“搬得出，稳得住，逐步能致富”的主要问题，从政策制定和政策执行两个层面分析原因，提出对策建议，促进移民安稳致富和库区经济社会发展。 审计中，该办围绕效益，以是否对政策及效益目标实现构成重大影响为导向，从资金性质和管理方式两方面，对三峡移民资金总体情况进行了梳理，将对移民安稳致富影响较大的后期扶持资金、库区产业发展基金等的审查摆在突出位置，建立效益评价指标体系，并对各项评价指标的定义、评价标准和数据获取途径进行了详细界定。在本次审计中，该办围绕审计目标，对发现的问题深入分析原因，并着重从促进政策完善、资金分配和资金使用三个方面提出了10条审计建议，均被国家有关部门和地方政府采纳。
