当前，社会保障基金不同程度地存在着使用效益不高、保障覆盖面窄、资金应征未征，发放不及时、保障标准不公平、应保未保等问题。解决这些问题，仅靠真实合法性审计难以奏效。为有效促进这些问题的解决，应将社保资金审计的重点由真实合法性审计转向真实合法性审计与效益审计相结合，由查处违法违纪问题转向查处违法违纪问题与检查管理漏洞和制度缺陷相结合，即在社保审计中全面贯彻效益审计理念。 ——在基金征收环节贯彻效益审计理念。首先要加强对社保扩面征缴的审计力度。当前不少城镇居民如外资企业、私人企业和个体工商户的从业人员大都还没有参加养老保险，经济效益不好的国有企业、集体企业职工，倒闭、破产的企业下岗职工，也大部分没有参加医疗保险，城镇居民最低生活保障也还存在着应保未保的情况。在此情况下，审计机关对社保基金的审计，应认真检查国家社保政策的落实情况，检查社保扩面征缴情况，促使经办机构努力做到应保尽保。其次要加强对故意偷逃、漏缴保费单位的审计。部分企业大量欠费，直接影响着社会保障基金的安全，也影响着其他参保人员的权益。审计机关应加强对征收环节的审计，突出重点单位、重点行业，检查申报缴费基数是否真实，是否足额缴费，有无漏缴或少缴的问题，保障社保资金的完整。 ——在基金管理环节贯彻效益审计理念。一要审计社保资金的拨付情况，分析资金的拨付效益。分析资金拨付效益需要从数量和质量两方面展开，即省和地方各级安排的专项资金和配套资金是否及时、足额拨付，拨付的具体方式和手段是否可行有效；有无截留、挤占、挪用和违规获取资金等问题，是否达到了预期的成效；有无因资金拨付不及时而影响被保障对象利益的问题。二要审计各级社保基金管理机构的监管情况，分析资金管理效益。分析资金管理效益主要涉及管理机构或项目管理方面的效益状况。如管理机构责任机制是否健全，管理方法和手段是否科学高效；是否执行了各项政策规定和管理办法，是否存在因管理不到位而带来损失和浪费，甚至损害了参保人员的切身利益。也就是从管理角度来分析被审计项目的效益状况，杜绝社保资金管理政策不落实、管理效率弱化的问题，降低社保资金运行的风险。三要针对审计中发现的制度缺陷，促进其完善规范，发挥制度效益。 ——在社保基金使用环节贯彻效益审计理念。在社保资金使用效益分析中，应该重点关注两个方面的内容：一是能够反映社保资金收支适度平衡的评价指标，包括当前社会保障资金支出占社会保障资金收入的比例、基金累计结余额、当前基金结余上升或下降率等；二是能够反映社会保障资金增值保值方面的评价指标，包括社会保障资金按法定投资方式获取的收益率、当期资金存款中已执行法定优惠利率的资金比例、当期社会保障资金增值率、增值率上升或下降幅度指标等。通过对这些指标的分析，发现社保基金使用环节存在的突出问题，找出规律性、倾向性问题，并针对这些问题提出我们的建议。 ——在社保资金公平效益分析环节贯彻效益审计理念。中国有句古话叫作“不患寡而患不均”，待遇的不公平容易造成人们心理的失衡，从而诱发社会的不稳定。因此，对社保资金使用公平效益予以关注应是社保审计的一个重要原则。在审计中，要十分注意检查社保资金使用的公平性，比如救灾资金使用是否公平，有无优亲厚友现象；低保资金使用是否公平，有无“富人”吃低保的情况；医疗保险基金使用是否公平，有无医疗保险待遇不公的情况等。
