一、明确高等院校科研经费内部审计的定位 １．高等院校科研经费是其内部审计的监督范围。据教育部科技司２００４年对全国７５１所普通高等院校及其２００个附属医院的科技统计，全国高校共筹集科技经费３４４．４亿元，其中政府资金１７２．４亿元，企事业单位委托经费１７０亿元，有３所高等院校科技经费超１０亿元，５－１０亿元的有１３所，３－５亿元的有１０所，１－３亿元的有５５所。高等院校科研经费是高等院校收入的一个重要来源，按照《高等院校财务制度》的规定，高等院校开展科研及其辅助活动所取得的收入纳入学校收入管理，在“科研事业收入”和“科研事业支出”中核算。根据审计署《关于内部审计工作的规定》，内部审计是独立监督和评价本单位及所属单位财政收支、财务收支、经济活动真实、合法和效益的行为，以促进加强经济管理和实现经济目标，科研事业收支是内部审计监督和评价的对象。同时，《国家杰出青年科学基金项目资助经费管理办法》、《国家自然科学基金项目资助经费管理办法》明确规定，项目依托单位应对项目资助经费进行定期或不定期审计或专项审计。《高等院校博士学科点专项科研基金管理办法》规定，博士点基金总决算表须经审计部门审核。 ２．内部审计部门应和国家审计机关协调审计工作。《国家杰出青年科学基金项目资助经费管理办法》、《国家自然科学基金项目资助经费管理办法》、《国家社会科学基金项目资助经费管理办法》等规定，项目资助经费的管理和使用应接受上级财政部门、国家审计机关、教育部或自然科学基金办或全国社科规划办的检查和监督。国家审计机关对科研经费的审计监督旨在维护国家财政经济秩序，保障国民经济健康发展，促进政府行为的公开透明，促进国家的民主法制建设和反腐倡廉。内部审计在科研经费的审计方面，要服务于提高科研经费的经济和社会效益，改进科研经费内部管理，也要对单位遵守国家法律和法规情况进行评价，及时纠正违反国家法律和法规的行为。内部审计与国家审计机关协调审计工作时，要围绕规范和加强经费管理，提高资金使用效益的目标，按照共享信息、协调活动，保证适当的工作覆盖面，尽可能地减少重复工作，突出重点，履行各自的职责，确定内部审计在科研经费管理中的作用。 ３．内部审计应努力促进科研竞争力的提高。通过内部审计，要为国家有关部门检查和考评打下一个基础。在审计过程中，对于不符合规定的，审计及时提出建议并报学校有关部门，学校督促相关部门拿出整改措施，项目负责人要充分认识国家有关部门的检查和考评结果的重要性。《国家基础科学人才培养基金项目资助经费管理办法》规定，项目考评结果作为项目承担单位以后申报项目资格审查的重要依据。根据项目考评结果考虑以后项目的安排，是所有科研项目安排的趋势，国家财政部门目前也正在调研实行绩效预算。 二、掌握高等院校开展科研经费内部审计的特点 １．通过对项目依托单位的内部控制制度，评价科研项目经费的内部控制。现代审计大都是以制度基础作为审计的基础，通过对内部控制的了解和评价，进而展开实质性审计。科研经费审计也要以制度审计作为基础，需要了解和评价科研经费的相关控制。由于科研经费是拨给项目依托单位的，对高等院校承担的科研项目经费的控制审计是对高等院校经费的控制审计项目之一。重点是评价科研经费管理的有关控制制度，检查高等院校自行制定的科研经费使用管理办法的合理、适当性，检查其制定的办法是否得到执行。高等院校制定的有关科研经费的管理办法，必须符合国家有关部门制定的科研经费管理规定，不得与其相抵触，主要是对有关项目内容作出具体规定，如明确国际合作与交流经费、劳务费、管理费的具体控制标准，对课题成果验收、决算验收、固定资产验收等程序性内容作出具体规定。 ２．遵守内部审计准则，依靠专家帮助。内部审计准则是内部审计的经验总结，遵守内部审计准则是保证质量的要求，是提高效率的要求，科研经费审计同样必须遵守内部审计准则的规定。但科研经费有的用于基础研究，有的用于应用研究，有的用于发现和培养人才，在经费管理和使用上特别提出了同时符合国家有关财政、财务制度和有利于开展科学研究工作的双重要求，内部审计必须依据科研经费管理的特点展开审计。在科研经费资助时坚持“依靠专家、发扬民主、公正合理、择优资助、专款专用”的原则，在科研经费审计时也要考虑聘请专家工作。 ３．强调经费使用过程审计，运用判断。科研经费用于基础研究和培养人才的效应不是支付后就能即刻看到的，几乎也没有直接的衡量标准，科研经费的管理和使用强调符合原定项目、用途，注重经费使用过程控制，检查是否符合预算，预算调整是否合理、合规，在评价上大多依赖于审计人员和专家的经验判断。 ４．抓住科研经费管理的重点、关注管理的盲点。按照科研经费的资助目标和经费使用管理原则，科研经费审计重点在于科研经费使用的用途、范围和开支标准。经费是否用于原定的科研项目是科研经费使用管理情况的最直接评价办法，特别是用于人才培养和基础研究的经费。同时在科研经费审计中要关注一些不易引起重视的事项是否得到管理，这些也是非常重要的，如自然科学基金项目资助经费需要调整，包括不可抗力造成意外损失的调整，也须按规定依程序报自然科学基金办批准，否则将会受到停拨资助经费、撤消资助项目等不必要的处理。
