２００５年１２月１４日，国家税务总局明确，自２００６年１月１日起，纳税人实际取得的工资、薪金所得，应适用新税法规定的费用扣除标准每月１６００元，计算缴纳个人所得税。 根据十届全国人大常委会第十八次全体会议《关于修改〈中华人民共和国个人所得税法〉的决定》，２００６年１月１日起，工资、薪金所得费用扣除标准将从每月８００元提高到每月１６００元。为使纳税人、扣缴义务人和基层税务机关正确理解执行新修订的个人所得税法，税务总局专门下发了《关于工资薪金所得计算缴纳个人所得税政策衔接问题的通知》，就费用扣除标准调整后的衔接问题进行了明确。 通知规定，２００５年１２月３１日（含）前，纳税人实际取得工资、薪金所得，无论税款是否在２００６年１月１日以后入库，均应适用原税法规定的费用扣除标准每月８００元，计算缴纳个人所得税。自２００６年１月１日起，纳税人实际取得的工资、薪金所得，应适用新税法规定的费用扣除标准每月１６００元，计算缴纳个人所得税。 举例说明如下： 某单位于２００５年１２月２８日向一员工发放当年１２月份的工资１３００元，并扣缴其应纳的个人所得税款，在２００６年１月５日缴入国库。由于该纳税人实际取得工资的时间是２００５年１２月３１日（含）之前，因此，应适用８００元的费用扣除标准来计算缴纳个人所得税，即扣缴个人所得税２５元。 某单位于２００６年１月９日向该员工发放２００６年１月份的工资１４００元，按照规定，这笔在２００６年１月１日以后取得的工资薪金所得，在计算个人所得税时可减除费用１６００元，因此不用缴纳个人所得税。 ２００６年１月１２日，该单位再向该员工发放年终一次性奖金５０００元，由于该员工当月工资薪金所得低于１６００元（只有１４００元），因此，应将年终一次性奖金减除当月工资与费用扣除额１６００元之间的差额后，计算缴纳个人所得税，即应扣缴个人所得税２４０元。计算过程为：应纳税所得额：５０００－（１６００－１４００）＝４８００元；确定适用税率和速算扣除数：应纳税所得额４８００元除以１２后为４００元，适用税率为５％，速算扣除数为０；应纳税额：４８００×５％＝２４０元。
