（一）资金逐笔核对法。以资金为主线，采取自上而下或自下而上的资金全程审计。对上级拨入的资金和拨往下级的资金，就资金名称、用途、时间、金额进行逐笔核对，看程序、申报、经办、审批、付款等手续是否齐全。同时，自下而上有必要查找施工单位的资金用途，查证被审计单位或施工单位是否改变资金用途。总之，顺着资金走向进行延伸审计，资金流向哪里，就延伸到哪；还要看工程进度拨款是否严格执行工程付款条款；看有无损失浪费的问题存在；是否存在大额现金支出；规定有违约金和保证金的，查看账面是否如实反映。 （二）图纸逐项比较法。从设计图纸入手，在基建工程决算审计中，审计人员要按设计标准和要求对工程进行重新测算，用自己的记录或资料测算的结果同实际的记录或资料进行查对，用相互验证和复核的手段，验证基建工程结算工程量与造价真实性。到竣工工程现场，对照施工图纸、竣工图纸进行比较，看是否布局合理、节约用地，建筑结构及材料、设备选型等是否科学合理。同时，以设计图纸重新测算的结果，看决算、结算工程的工程造价及附属项目的套用标准是否一致，主要结构的面积、长宽尺寸是否严格按设计图纸执行，是否任意扩大建设项目和改变设计结构。 （三）合同逐款梳理法。从合同入手，审计施工单位的资质、项目投标中标过程的合法性。以列表的方式对所有的合同项目进行梳理，审查合同的工程内容、承包范围是否明确；审查合同工期、质量等级、合同价款是否按中标价格签订的；检查有无附属工程合同或补充合同；审查结算条件和违约责任是否齐全；看施工单位资质与投标文件中的资质是否一致，有无串通招标或压低报价的行为来达到中标的目的；检查工程各项签证手续是否齐全；检查有无直接发包或转包和冒名顶替投标的行为；看工程决算有无明细账。 （四）现场测量抽查法。对审计事项有重点地进行实地测量，核实工程实际量，有必要开挖实地测量隐蔽工程，核实竣工工程执行施工图纸的程度。审查是否改变材料用量、型号；是否增减基建项目结构质量；是否有超越范围的附属工程等。对工程量大的项目，按照结构分类，每一类型抽查一个或几个点，举一反三，主要检查钢材、水泥、门窗、水暖、电力设施等材料质量、价格、标准是否按设计要求执行，有无以次充好，以劣充优和偷工减料的问题。 （五）辐射调查分析法。任何一个项目都不是孤立的，从招投标开始到项目竣工全过程与社会各方面总是有联系的。要调查共同投标人，看在招投标中有无暗箱操作的隐情；调查了解社会群众、各部门，寻找工程建设过程中违纪违规的蛛丝马迹；调查了解监管人员、施工单位与组织之间的关系，看是否存在主管单位与施工单位“自弹自唱”的违纪违规行为；调查参与项目管理的负责人、当事人和知情者，了解和证实项目工程建设的真实性和合理性，通过调查和各方面的反映，分析比较验证各种资料和信息的准确性，从而发现疑点，揭露问题。
