一、税收基础工作方面：１、税务登记及管理情况。审查是否按规定对辖区内所有已办工商登记手续的单位和个人办理了纳税登记手续，有无漏户现象；登记的内容是否全面、清楚；纳税人发生变化是否及时办理了变更登记、重新登记或注销登记等。审查税务登记管理制度是否健全，是否建立税务登记档案及变更登记清册；对辖区税源监控是否到位；对定额征收工商户的税额评定是否依照有关规定进行等。２、纳税申报情况。审查纳税人是否按规定及时、足额申报，有无故意漏报、错报的情况；税款超过期限是否及时催缴入库等。 审计的主要方法：采取“对比法”、“抽样法”、“延伸调查法”等，将从工商管理部门取得的工商登记户与地税部门的纳税登记户对比分析，可确定未纳税登记的漏征漏管户。分行业（如房地产业）或纳税额（如重点税源户）抽取一定比例的纳税申报资料，审核其是否在规定期限内提交了完整的纳税申报资料，税务机关归档的申报资料是否齐全，调阅相关的台账、完税凭证、实缴税款情况，延伸至纳税单位与账面应纳税情况核对，揭示税务部门纳税管理环节存在的漏洞。 二、税款征收入库方面：１、税款征收情况。审查是否按纳税人申报的税种、税额及时、足额征收到位；完税凭证填写是否完整、准确；有无漏征、少征税款的现象；有无包税或变相包税、征收“过头税”或“引税”、有税不征或以欠代免的隐瞒税源现象；有无弄虚作假以减免税名义截留税收的情况；有无擅自变动纳税依据、税率和纳税环节的情况；２、税款缴库及各种税收过渡户、税款预储专户撤并情况。审查税款缴库是否及时、足额，有无延压；有无通过滥设过渡户，隐瞒、截留、挪用税款的行为；税款是否按原始税票、税种及属地入库，有无人为调节税种和税款属地的现象；有无改变税种挖挤上级收入的行为；是否按规定取消或撤并了税收过渡户、税款预储专户等。３、税收滞纳金、罚款情况。审查税收罚款、滞纳金是否按其正常渠道缴库，税收罚款是否随正税缴库，有无不分税种以罚没款或其他收入缴库，有无截留坐支罚没收入问题。 审计的主要方法：采取“分析法”、“抽样法”、“顺查法”，将本期税收征收情况与近期和上年同期征收情况进行对比分析，分析税收收入异常变动差异及可能的原因，确定审计重点。抽取一定比例的完税凭证和相关纳税单位征管资料相互核对，确定税种、税额是否相符，以及串库、混库等情况；抽查重点税源户的税款完税凭证，并与相关纳税资料核对，查实是否存征“过头税”、垫税等问题。核对完税凭证、汇总缴款书（或税收缴款书）、国库收入日报表是否相符，是否存在税种、税款不符等问题，并可通过汇总缴款书等入库凭证发现是否存在税收过渡户、税款预储专户，隐瞒、截留、挪用税款等问题。 三、税收政策执行情况方面：１、特定区域、特定行业的税收优惠。包括开发区、高新区等特定区域；对特定行业的优惠政策，包括新办企业、民政福利企业、校办企业、中介服务机构等等。审查其是否存在区内注册区外经营的问题、假民政企业真逃税的问题、新办企业优惠到期后注销，重新注册再享受税收优惠的问题等等。２、重点税种的税收减免。审查营业税、企业所得税等重点税种的税收减免情况：税收减免是否超越减免权限，减免内容是否符合政策规定的范围等。如企业技术改造国产设备投资抵免企业所得税优惠中，其技术改造项目是否符合国家产业政策，抵免的投资是否是从企业技术改造项目设备购置当年比前一年新增的企业所得税中抵免企业财产损失税前扣除，新办劳动就业服务企业减免税中安置的待业人员是否达到规定比例等等。３、地方政府自定政策。是否存在地方政府在国家规定之外“开口子”自定政策，与税收条例不符的情况。如对小企业和私营企业定额纳税或采取附征率的办法征收企业所得税。无论企业是否盈利，按销售收入的一定比例征收企业所得税，此外，近年来各级地方政府为搞活经济纷纷出台“招商引资”政策，“招商引资”中对原来是地方收入的企业所得税进行先征后返，税务机关征收企业所得税入库之后，财政部门再以“退库”的方式将税款返还给企业的问题。 审计的主要方法：采取“抽样法”、“延伸调查法”。收集整理有关税收优惠政策方面的法律、法规及文件规定，把握政策界限；取得或编制审计时间范围内税务机关减免税统计表（包括单位名称、减免类型、文件依据、减免期限、批准文号等），根据减免税款和减免类型抽取一定比例的减免税款和减免单位，通过调阅减免档案及相关资料，对照政策规定是否存在擅自审批或越权减免、延长减免期，以及弄虚作假的问题。 四、票证管理方面。审查票证管理制度是否建立健全，票证的领用、作废票证的核销手续是否齐全并定期结报，有无自制票据情况，收费票据是否统一、规范，收费标准和收费项目是否符合规定等。 审计的主要方法：采取“分析法”、“抽样法”。调阅票证管理制度，分析是否具备可操作性、是否完善，执行效果是否理想；查阅票证月报表、台账，与库存票证核对是否一致；抽查票据结报情况，是否存在人为压票，从而挪用、贪污税款的问题。审查收费票据的使用情况，是否存在使用工本费收取其他费用或罚没款的问题等。
