内部审计职业化在审计组织、人员、业务等方面的管理模式上与注册会计师具有诸多共同之处，但实行内部审计职业化的目的，就是将社会审计管理机制、经营模式引入内部审计，使内部审计更具活力。严格来说，职业化的内部审计与社会审计有着较大不同。其主要区别在于： （一）审计委托、受托关系建立的基础不同。注册会计师审计的委托、受托关系建立在不同的经济组织之间的受托经济责任基础之上，注册会计师所面对的是被审计单位的外部经济责任。例如，注册会计师接受政府及其有关部门、企业投资者、金融机构等经济组织委托，对被审计企业向政府及其部门、企业投资者、金融机构承担的保证资产安全完整、会计资料真实公允等经济责任进行评价，所评价的都是企业向外承担的经济责任。同时，这种委托、受托的范围也比较广泛。内部审计的委托、受托关系建立在企业内部分权制所产生的内部经济责任关系基础之上，其委托人主要是代表投资者、由股东大会选出的监事会或审计委员会。 （二）审计的基本目标不同。注册会计师审计的目标是证实企业会计资料的真实性、公允性。内部审计作为企业内部的一种监督制约机制，是企业现代经营机制的重要组成部分。企业设立的监事会或审计委员会应是受投资者特别是大多数中小股东授权，对董事会的重大决策、对经营者的经营管理进行评价监督，并通过建立健全内部控制制 度，促使企业重大决策和经营管理规范、合理、有效。 （三）审计对象范围不同。注册会计师审计的对象和范围主要是被审计单位的资产负债、所有者权益和会计资料。内部审计评价监督的是企业内部经济责任，是企业内部不同层次的经营主体。在现代企业里，董事会、监事会和经营管理者都是由投资者授权，负责企业决策、监督和管理的三大制约因素。监事会或审计委员会通过委托内部审计组织对董事会重大决策活动和企业经营管理活动进行评价，监督企业投资者授予的权力运用是否科学、合理。 （四）审计服务方式不同。在服务方式上，社会审计为企业服务的过程主要是一次性服务，即完成一个项目后，其服务也便结束。有委托才有审计，而内部审计服务的方式是常年性的，与企业决策、经营管理活动是同步进行的，其服务则包括事前服务、事中服务和事后服务。 （五）审计层面不同。注册会计师审计作为一种外部审计，无论是对企业资产评估，还是对企业资产价值验证，以及审查企业会计报表的真实性、公允性，都是评价企业的整体经济责任，其层面较单一。内部审计是针对企业内部多层次的不同责任，包括董事会向股东承担的决策责任，经营者向董事会承担的经营责任，以及各个业务部门向最高管理层承担的管理责任等，这种责任具有较高层次，也有较低层次的，是包括多层次的经济责任。
