一、业务经营 （１）关联方交易。有的上市公司通过关联方交易将巨额亏损转移到不需审计的关联企业，隐瞒真实的财务状况。有的则与其关联企业杜撰一些复杂交易，单从 会计方法上看，其利润的确认过程完全合法，但它却永远不会实现。由于关联交易的复杂性及内部控制、审计测试固有的局限性，注册会计师很难发现关联方及其交易的所有错报、漏报。（２）非常交易。不少上市公司为了“扭亏为盈”或达到规定的配股条件，常常采用非常交易，如出让土地、设备、股权等，年末发生非常销售业务、收取政府补贴等，从中获取非常收益。（３）非货币0性交易。有许多上市公司的交易业务是非货币性的，如转让土地、股权等巨额资产，没有现金流入，只是借记应收账款，同时确认转让利润。还有一些公司通过非法渠道将资金拆借出去，或者将资金投入子公司，这些资金或资本实际上已难以收回，却仍在以此确认利息收入或投资收益。（４）跨地区交易和涉外交易。许多上市公司的业务是跨地区甚至是跨国经营的。有的国家或地区可以以一元钱注册一个公司去进行数亿元的业务而没有法律限制；多数上市公司在全国各地有子公司或分销点，致使审计范围受到限制，严重困扰注册会计师实施审计程序，审计风险便在所难免。（５）主营业务严重亏损。与上述几种情况相关联的是，一些上市公司的主营业务不突出，甚至是亏损。已亏损上市公司的许多扭亏，也是通过非常交易、非货币交易、关联交易等手段而不是通过主营业务来实现。 二、资产重组 如股权变更的标志是什么？如何确定重组购买日？重组相关公司的优质资产、不良资产的计价标准是否一致？资产置换、注入优质资产、剥离不良资产、剥离非经营性资产的会计处理是否合法、合规和公允？被购并方的债权债务是否真实？是否存在有负债或损失？重组中是否存在操纵利润、虚盈潜亏的问题？对关联单位、关联交易的界定是否准确？对关联交易的计价和会计处理是否正确？这些问题的存在，大大增加了注册会计师的执业难度和风险。 三、复杂的控股关系 有的公司为了达到一定目的，会通过各种办法改变股权结构。从表面上看，有些交易是两个独立法人之间的交易，而实际上是关联交易。由于我国目前还没有披露终极所有者的规定，许多注册会计师也很少关心上市公司与其子公司之间的真正关系，往往看不出公司安排的圈套。 四、法律纠纷 由于种种原因，现在越来越多的上市公司涉及法律纠纷，有的公司甚至同时涉及多个法律纠纷并造成数量不等的负债或损失，致使公司陷入极度财务困境甚至失去持续经营能力。 五、违法违规的融资行为 上市公司改制上市以前，往往没有仔细考虑将筹得的资金投入何种项目，资金筹得后，又面对股民要求报酬的压力。于是，就很容易出现乱存乱投现象，各种非法和非规范的融资行为也应运而生。如有的给集团公司长期占有，有的存在境外金融机构炒外汇，有的请证券公司炒股票等等。 六、审计报告的公开化 由于公众对注册会计师审计行为的性质、审计报告的意义存在着误解，混淆了被审单位的会计责任和注册会计师的审计责任；或者对审计的期望值与审计实际所起的作用之间存在着差距。 七、知识经济时代的新要求 如高新技术企业不断地涌现出来，这些企业的技术带有较大的开创性，在技术和市场上不会很稳定成熟，因此尽管增加了企业的收益，与此同时也加大了企业的经营风险。另外，知识经济时代的审计目标将不再仅仅局限于对企业会计报表发表审计意见，而且要借助于各种信息来预测企业的盈利能力、偿债能力、持续经营能力等。 八、会计电算化的应用和网络技术的发展 审计人员除了对传统的诸如会计报表、账册凭证等审计对象进行审计外，还应对计算机会计信息系统本身进行审计。只有开展计算机辅助审计，才能对被审计的会计电算化系统作出客观的、公正的评价。但是，目前审计电算化的研究才刚刚起步，相对滞后于会计电算化。加上审计工作本身的规范性要求尚未能普遍得到很好地执行，也为开发研究计算机辅助审计软件和应用计算机进行辅助审计带来了难处。审计人员对利用计算机信息系统处理经济业务的企业进行审计时缺少计算机辅助审计环节，将为他们的审计结论意见带来难以预测的风险。
