任期经济责任审计评价首先要利用的是财务会计档案的证据作用。任期经济责任审计常规的审计评价内容，一般都要对被审计单位的财政、财务收支及有关经济活动的真实性、合法性和效益性进行评价，这些评价都离不开对财务会计档案的有效利用。如真实性评价，就是根据现行任期审计制度规定需要评价的内容，对被审计单位提供的财务会计档案资料进行检查和核对，看被审计者述职报告反映的任期经济责任事项是否有出入，看被审计者任期内有关财政、财务收支及有关经济工作目标是否如期完成，相关数字是否真实，进而得出被审计者任职期内财政、财务收支及有关经济活动真实或基本真实或不真实的审计评价；又如合法性评价，就是根据现行的国家法律法规的规定，对被审计单位提供的财务会计档案资料进行检查和核对，看被审计单位是否存在违反国家财经法律法规的规定的行为，是否存在违反财经纪律的行为，是否存在国家明令禁止的行为，进而得出被审计单位的财政、财务收支及有关经济活动合规合法或基本合规合法或违规违法的审计评价；再如效益性评价，就是根据对被审计单位提供的财务会计资料进行检查和核对后获取的有关数据进行审计分析，进而对被审计单位财政、财务收支及有关经济活动的经济效益、社会效益或者资金使用效果的好坏与高低进行审计评价，以及对被审计者及相关责任人员在本单位实现利润最大化或资金使用效果最大化过程中发挥作用大小进行审计评价。如果被审计单位提供的财务会计资料记载不完整，不全面，不连续，任期经济责任审计就不可能取得必要和足够的审计证据；没有必要和足够的审计证据，任期经济责任审计评价不可能真实，客观和公正，严重的还会导致任期经济责任审计工作的失败。 任期经济责任审计评价其次要考虑的是财务会计档案的重要参考作用。任期经济责任审计最终要求通过审计查证工作，分清被审计者对所在部门和单位的财政、财务收支及有关经济活动的主管责任和直接责任。而要做到这一点，任期经济责任审计实践证明的确不是一件很容易的事。因为被审计者对所在部门和单位的财政、财务收支及有关经济活动的主管责任和直接责任往往与其他相关责任交织在一起，很难明确予以划分。比如如何准确地划分党政领导干部和国有企业领导人员与其领导班子其他成员及其合作者之间、与本单位的其他相关责任人员之间、与所属单位的有关责任人员之间的有关主管责任与分管责任的界限，直接责任与间接责任的界限，会计核算责任、财务管理责任、经济法纪责任、经营管理责任、目标管理责任之间的界限；如何准确划分相关责任产生的主观因素与客观因素；如何准确划分有意违规违法与无意违规违法的责任界限；如何准确划分钻改革空子与改革失误的责任界限等等。在上述相关责任界限划分方面，被审计单位的财务会计档案的参考作用是相当突出的，这一点也为任期经济责任审计实践所证明。审计组织通过对被审计单位提供的财务会计资料的查阅和核对，了解被审计单位财政、财务收支及有关经济活动发生和发展的全过程，了解在这一过程中相关责任人的职责和义务的履行情况，了解相关责任人对导致本单位财政、财务收支及有关经济活动结果作用发挥的大小，最终对审计组织准确地划清相关的责任界限，坚持谨慎性和稳健性的审计评价原则，在真实反映被审计单位财政、财务收支及有关经济活动情况的基础上，正确地作出任期经济责任审计评价起到了十分重要的参考作用。 任期经济责任审计评价第三要考虑的是财务会计档案的索引作用。在开展任期经济责任审计工作时，往往有些资料不能直接从财务会计档案中直接获取，这时财务会计档案的索引作用就显得十分重要了。比如被审计单位有关重大财政、财务收支及有关经济活动的决策，被审计单位提供的财务会计资料中一般是不反映的，审计组织可以通过对财务会计档案的查阅，依据其提供的线索，追踪查阅被审计单位的其他相关资料，以进一步分清该项重大决策是属于集体决策的责任，还是个人决策的责任；又比如对任期经济责任审计中发现的重大经济案件，也是依靠被审计单位财务会计档案提供的线索，进行进一步查证确认，并依据有关的法律法规依法进行处理处罚。
