审计中处处要遇到怎样充分利用审计资源、提高效率，以求得最佳审计效果的问题。比如，某项审计工作由现金、应收账款、存货和固定资产四部分组成。四位审计员张、李、赵、王完成这四项工作所需时间（时间：天）。安排张、李分别做现金、应收账款，所用时间为２天、４天；赵、王做固定资产和存货，时间为１３天和１１天。于是这项审计共需３０天。从张、李角度看，这个安排最优，但从整体上看不如安排张、李、赵、王分别做固定资产、应收账款、现金和存货，总共只需２８天。因此局部优，不等于整体最优。 再如，选择审计重点要考虑以下因素：是否党政工作重点，是否改革中难点，是否社会关注热点，历年审计情况，是否高新技术产业，固定资产，利润，负债率，现金流量等。这些指标计量单位不同，重要程度也不同。如果能综合这些因素，就能最终计算出每个单位的重要性系数Ｗｉ，比如在５２１０个单位中，第１６号单位重要性系数Ｗ１６＝９２０５最大，Ｗ１０８＝９１７８列第二，说明第１６号单位最重要，第１０８号单位其次。整体与部分遵从不同层次上的规律，这是系统科学的核心思想；一切论断或决策尽量用数字说话，定性是定量的基础，定量是定性的精化，这是系统科学的精髓。我们应该重视系统科学在审计中应用的问题。 凡客观存在于被审计单位，已经发生、正在发生或将要发生的经济活动，都是审计的对象。因此，审计涉及领域广泛，研究对象复杂。审计工作的核心是“进行审核检查”，审计的目的是判断审计对象的“合规性、合法性、合理性和有效性，以及有关资料的真实性、公允性”。所以，从本质上说，审计也是研究对象功能行为的。可以预料，如果我们将系统科学中的演化、涨落、整体性、层次性等概念与原理融会贯通于审计全过程，就能丰富具有中国特色的审计理论；如果我们将系统科学中的计划与预测、评价与决策等方法应用于审计业务与管理中，并由此编制计算机辅助审计软件，就能合理配置、充分利用审计资源，从整体上取得最佳审计监督效果。
