一、违纪问题下沉，违纪手段隐蔽化。经过连续多年的预算执行审计，中央部门一级预算单位的违纪现象明显减少，而二、三级预算单位的违纪现象仍较普遍，且违纪手段趋于隐蔽化；表面的、浅层次的违纪现象减少了，深层次的违纪问题仍大量存在。 二、滞留资金现象普遍，影响财政资金的使用效率。审计的结果表明，预算资金拨付不及时，大量资金滞留在中央部门一、二级核算单位，不仅违反了《预算法》的有关规定，而且直接影响了财政资金的使用效率。 三、转移预算资金，形成资金体外循环。一些部门违反规定，将已核销的预算资金，通过化整为零的方式，将部分专项资金转移到相关单位，形成资金的体外循环。 四、预算批复不及时，债权债务反映失实。由于内部管理不协调，造成某些工程项目长期不结算，预算批复不及时，债权债务反映严重失实。 五、预算收入上交不及时，隐瞒、转移收入不同程度地存在。有预算收入上缴任务的部门和行政性收费的部门，未严格执行“收支两条线”的规定，不同程度地存在着收入上交不及地与隐瞒、转移收入的现象。
