１立项依据不同。一般审计项目立项依据为本局年度审计工作计划；任期经济责任审计依据为本级人民政府的审计指令或同级组织人事部门、纪检监察机关的委托。 ２审计时间范围不同。一般审计项目只审一个年度的会计资料；任期经济责任审计要审领导干部任职期间的全部会计资料，如果任职时间较长，则可重点审计近几年的会计资料。 ３要求被审计单位和被审计人员提供的资料不同。一般审计项目要求提供被审计单位的有关会计凭证、账簿、会计报表、经济合同、经营决策等有关资料；经济责任审计除了要求这些资料外，还要求被审计人员写出任期内负有主管责任和直接责任的财政收支、财务收支事项的书面材料。 ４采用的审计方法不同。一般审计项目采取详查和抽查相结合、内控测试、抽取样本、实地盘点等方法；任期经济责任审计除采取这些方法外，还要采取个别谈话、问卷调查、开座谈会等形式。 ５审计报告的内容不同。一般审计报告内容主要包括，被审计单位的有关情况、与审计事项有关的事实、对审计事项的评价、所依据的法律法规和处理处罚意见；任期经济责任审计报告，除了上述内容外，还要包括领导人员在任职期间的经济指标的真实性、效益性情况，以及领导人员任职期间遵守国家财经法纪、廉洁自律情况等。 ６报送对象不同。一般审计项目的审计意见书、审计决定，报送本级人民政府和上级审计机关；任期经济责任审计结果报告，报送本级人民政府或委托机关，并抄送同级组织人事部门、纪检监督机关。
