贷款利息收入审查的程序和方法可分为三个阶段： 第一阶段，取得资料。采用这种审查方法必须首先取得被审单位的贷款备查帐。贷款备查帐一般按正常贷款、逾期贷款(逾期未满二年)、呆滞贷款(逾期满二年)分设帐簿，按户分笔设置帐页，逐笔登记贷款本金的发生、收回及余额，应计利息、实收利息及应收未收利息余额。 第二阶段，分析性复核。按公式“实收利息(备查帐数)一年初应收未收利息(报表数)＋正常及逾期贷款年末应收未收利息(备查帐数)”计算金融企业当年按规定应反映的贷款利息收入，并与该企业报表上实际反映的贷款利息收入相对比，如无差异或差异不大，说明该企业真实地或基本真实地反映了其贷款利息收入；如果差异较大，说明该企业未能真实地反映其贷款利息收入，应作实质性审查。 第三阶段，实质性审查。上述差异结果有两种： (一)报表所列示的贷款利息收入大于应反映的贷款利息收入。说明该企业有虚列贷款利息收入的行为，为进一步取得其虚列贷款利息收入的证据，应对每笔贷款利息收入进行审查，特别是对计提应收利息的业务，应核对贷款备查帐、贷款合同，看其是否对不应计提应收利息的呆滞贷款计提了应收利息，或多提正常贷款、逾期贷款的应收利息并列入了当期损益。 (二)报表所列示的贷款利息收入小于应予反映的贷款利息收入。说明该企业有隐瞒贷款利息收入的行为或少提应收利息的行为。首先将备查帐中所反映的正常贷款、逾期贷款年末应收未收利息与报表列示的年末应收未收利息相对比，前者大于后者的差额，就是其少提的应收未收利息。其次将备查帐上反映的实收利息与帐簿记录中所反映的实收利息(包括贷款利息收入中实收利息部分和冲减应收利息的实收利息)对比，前者大于后者的差额，即为其隐瞒的实收利息。为进一步审查隐瞒的实收利息的去向，可逐笔审查备查帐实收利息记录，看其是否在“贷款利息收入”或“应收利息”明细帐贷方有所反映，如无反映，记入了哪个帐户，该帐户就是其隐瞒利息收入的去处。当然这种审查方法的工作量相当大。从以往的金融审计案例来看，被审单位多将利息收入隐瞒在“实收资本”、“资本公积”、“盈余公积”、“金融机构往来收入”、“应解汇款”等帐户中，审计时可先审查这些帐户。由于这些帐户正常业务量不大，如是将利息隐瞒其中，比较容易发现，如果仍不能查出，则只有按前述方法进行。
