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科研水平的高低是高校综合实力的重要标志。高校科研经费主要用于开展基础研究，其执行国家研发投入的比例较高，研发支出与国内生产总值相关。中国高校科研经费管理中面临体制机制问题，即国家研发经费投入不足，投入结构不够合理；经费来源渠道多样，但缺乏科学的统筹管理；经费拨款方式有待改进，科研成本核算不清；经费使用规定不够合理，缺乏有效管理办法，影响了科研创新。因此，要明确基础研究的战略地位，在科研中培养创新人才；加强高校基础研究投入，调整科研经费投入结构；完善科研经费使用管理办法，补偿科研人力成本；改革科研评价体系，提高科研经费使用效益，健全高校科研经费管理制度。
图1 美国高校1970～2006年研发支出的科研活动类型 一、高校科研经费的功能定位与国际比较 1.高校的科研经费主要用于开展基础研究 高校的科研经费主要用于基础研究，美国高校科学研究的历史经验很好地体现了这一点。1970～2006年的近三十年时间中，美国高校研发支出用于基础研究的比例基本维持在70％左右(如图1)，高校是承担基础研究的主要部门。③(P1)某种程度上，一流的基础研究是世界一流大学的重要标志，国际科技的竞争就是基础研究的竞争。基础研究的开展有助于提出原创性知识，从而占领科技竞争的制高点；同时，还可以通过基础研究培养人才、锻炼人才、储备人才，进而实现人才强国的跃迁。因此，基础研究具有非常重要的地位，高校科研经费在其中发挥着至关重要的作用。 就中国而言，目前高校科研涵盖各个基础研究领域，是基础研究的中坚力量、人才培养的重要基地。2006年，高校基础研究经费总额首次超过政府科研机构，成为中国基础研究的主力军。2007年，高校基础研究经费为86.8亿元，占高校研发经费的27.6％；与2006年相比，基础研究经费增长幅度达到21.7％，应用研究经费增长了17.9％，试验发展经费减少了3.1％。2010年，高校基础研究经费总额为179.9亿元，与上年相比增长了23.7％，比全国基础研究经费增速高出3.7％；基础研究活动占到全国基础研究活动的55.4％。④ 2.高校科研执行国家研发投入的比例较高 1995～2007年，经济合作与发展组织(OECD)成员国(澳大利亚、奥地利、比利时、加拿大、捷克、丹麦、芬兰、法国、德国、希腊、匈牙利、冰岛、爱尔兰、意大利、日本、韩国、卢森堡、墨西哥、荷兰、新西兰、挪威、波兰、葡萄牙、斯洛伐克、西班牙、瑞典、瑞士、土耳其、英国、美国)由高校执行的国家研发投入比例基本维持在17.2％，其中1995年最低，约为16.2％；2004年最高，约为17.7％。2007年，八国集团成员国(德国、加拿大、美国、法国、意大利、日本、英国和俄罗斯)中，加拿大高校执行的国家研发投入比例最高，为33.7％；俄罗斯最低，为6.3％；美国为13.3％(如图2)。同期，欧盟平均值为21.8％。中国高校执行的国家研发投入比例在1995～2007年间呈现逐年下降趋势，平均值约为10.1％，与经济合作与发展组织成员国平均值相比约低7.1百分点；2007年为8.5％，与经济合作与发展组织成员国平均值相比约低8.7百分点。⑤(P41) 
图2 八国集团成员国及中国高校1995～2008年执行的国家研发投入比例 近十年来，中国高校研发经费绝对数额逐步增加。2010年高校执行研发经费为597.3亿元，比上年增长27.6％，约占国家研发投入的8.5％。2010年，中国共投入研发经费7062.6亿元，约占国内生产总值(GDP)的1.76％(如表1)；其中基础研究经费投入为324.5亿元，约占研发经费总额的4.6％。⑥美国、欧盟和日本等国每年研发经费投入占国内生产总值的比例均在2.5％以上，与中国2010年约1.8％的比例相比高出了0.7个百分点。 
3.高校研发支出与国内生产总值相关 1995～2007年间，经济合作与发展组织成员国高校研发支出的平均值为各国国内生产总值的0.38％，其中1995年最低，约为0.33％；2003～2007年基本维持在0.39％。2007年，八国集团成员国中，加拿大高校研发支出占国内生产总值的比例最高，约为0.63％；俄罗斯最低，约为0.07％；美国约为0.36％(如图3)。同期，欧盟平均值约为0.39％。中国高校研发支出占国内生产总值的比例在1995～2007年间呈现逐年递增现象，平均值约为0.12％，与经济合作与发展组织平均值相比低0.26百分点；2007年为0.12％，比经济合作与发展组织成员国平均值低0.27百分点。⑤(P69)
