2003年全国22所高校自主招生方案出台，由于是首次自主招生，各试点高校都采取了审慎的态度，对方案的设计等方面都采取了比较严格的措施。因此今年的高校自主招生在社会上的非议比较少。但改革并不意味着进步，它的价值只能用它所代表的方向即它对整个制度的影响加以判断。笔者从以下两方面对高校自主招生作了深层次的价值剖析：(1)高校的自主权是谁的自主权？应该承认，扩大高等学校办学自主权，是建立社会主义市场经济体制的必然要求。但学校的办学自主权是有限度的，需要国家加以宏观调控，而且随着高等学校职能的扩大和对国家、社会的重要性日益突出，这种调控也必然不断加强。毕竟高校是由行政官员、各类教师这样一些有血有肉的个人组成的。从经济理性上看，他们的思维方式与一般人无多大区别。因此，高校招生在政策的执行，通常是充分进行成本和收益的比较之后作出的，这不利于维护考生的利益，使有能力的考生按理想报考。高校因为不能真正保证自己的生源质量，也无法真正实现办学的自主权。(2)高校自主招生何以实现教育公平？笔者认为高校自主招生有可能是对公平选才的一次严重冲击。首先，自主招生中，由于不同学校所选取的考试内容不同、方式不同，抹杀了高招中的可比性问题。由于不具有可比性，录取谁不录取谁就成为一件相当繁琐的事情，这往往成为高校自主招生被人们诟病的地方：其次，名额投放扩大了地区差异；最后，高考成本增加也会造成新的不公。
